Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms