Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms