Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gdf5P43027 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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