Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VhlP40338 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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