Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cap1P40124 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cap1P40124 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cap1P40124 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cap1P40124 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cap1P40124 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cap1P40124 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms