Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms