Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SsbP32067 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms