Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms