Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms