Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3aP23116 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms