Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms