Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Spta1P08032 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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