Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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