Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Edil3O35474 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms