Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LhbO09108 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LhbO09108 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LhbO09108 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms