Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms