Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PbsnO08976 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PbsnO08976 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms