Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms