Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms