Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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