Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef1G3X9K3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms