Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms