Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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