Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms