Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms