Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms