Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm17333C6EQI3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm17333C6EQI3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm17333C6EQI3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm17333C6EQI3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm17333C6EQI3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm17333C6EQI3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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