Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mterf1bB9EJ57 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mterf1bB9EJ57 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms