Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms