Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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