Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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