Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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