Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms