Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hdac6Q9Z2V5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hdac6Q9Z2V5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hdac6Q9Z2V5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hdac6Q9Z2V5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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