Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms