Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms