Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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