Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms