Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Limd1Q9QXD8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Limd1Q9QXD8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Limd1Q9QXD8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Limd1Q9QXD8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms