Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms