Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms