Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp29Q9ES63 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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