Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3bQ9ES34 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms