Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc97Q9DBT3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc97Q9DBT3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc97Q9DBT3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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