Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tmem239Q9DA47 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Tmem239Q9DA47 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem239Q9DA47 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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