Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms