Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms