Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms