Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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