Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms